日本人具有一些中国血统，但并非中国人的直接后代，是由外来移民和土着人融合而来混血民族。

日本人的主体民族是大和族，但并不是说日本国内民族只有大和族，日本国内还有阿伊努、琉球、鄂罗克等诸多少数民族，这些少数民族尤其是阿依努人是日本列岛地道的原住民。我们现在所说的日本人主要是指大和族。一般认为，大和族主要是由绳文人和弥生人融合外来移民形成的混血民族。

日本列岛最早什幺时候出现人类目前尚无定论，有学者认为50万年前，也有人认为100万年前，主流说法认为是20万年前日本出现人类，不过已知的日本最早人类化石仅仅追溯到约3万年前。大约15000年前，一群群追逐猎物的游牧猎人通过萨哈林的陆桥进入到日本，并在此定居。他们以渔猎为主，由于製作绳文图案的陶器，因此被称为绳文人，虾夷人（阿依努人）很可能就是他们的后裔之一。在库页岛、西伯利亚以及勘察加等地有分布有绳文人的遗蹟，日本的绳文人无疑是其中的一支。

大约公元前300年，从东部大陆的渡海而来的移民到达日本南部，他们带来了照叶树林文化（烧垦文化）、水稻以及青铜器等先进技术，使得日本从石器时代一下跃入了金石并用时代，进入了文明进程。这些带来先进技术和文化的移民被称为弥生人，也叫渡来人，意思是渡海而来的人，他们创造了灿烂的弥生文化。

弥生人很可能来源于中国的东南部的吴越地区，是春秋末期吴国遗民。公元前473年，夫差兵败，吴国灭亡，部分吴国移民浮海而走，辗转来到日本南部，成为弥生人。弥生人出现的时间和吴国遗民外迁相吻合,突然出现的水稻种植和烧垦文化以及弥生人生活方式都具有浓浓的吴越特色，外貌特徵和体质也和吴越人非常接近。连日本古籍中记载自己是「吴泰伯后裔」。汉隋时期，倭王遣使来华，都表称「日本王室是吴泰伯后裔」。吴太伯就是吴国的开国之君，吴王夫差的先祖。这些事在《魏略》、《晋书》、《梁书》、《北史》等史书都有记载。当然弥生人并不仅仅包括来自中国东南部的吴越人，还有中原人、西南夷、朝鲜人、马来人、波利尼西亚人等其他族群，这些族群统称为弥生人，有的来的甚至比吴越人都早。

弥生人凭藉先进的技术和文化逐渐取代了遍布日本列岛的绳文人，并逐渐融合。公元1世纪末，九州地区的邪马台氏族征服其它氏族，建立了一个鬆散的联盟，取得了霸权。邪马台国在女王卑弥呼去世后就开始衰落了，陷入了内乱。3世纪左右，在奈良县一带的大和国兴起，逐渐统一了日本大部分地区，最终形成了大和族。

所以说，日本人并非中国人的直接后裔，而是具有中国血统的混血种族，血统複杂到连他们自己都搞不清楚。加上历史上徐福东渡、汉献帝子嗣举族迁倭甚至太平天国战败外逃倭岛等多次移民潮，使得日本和中国的血统混杂不清，有很多日本人甚至直接认同自己是中国人后裔。日本前首相羽田孜就称自己是徐福的后裔。